环境生物多样性

描述说明:环境微生物多样性云分析流程,基于二代测序平台,对16S/18S/ITS/功能基因等特定区段PCR产物进行高通量测序,探索环境样本中微生物群落结构、进化关系以及微生物与理化指标相互作用等信息。

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医学微生物多样性

描述说明:医学微生物多样性云分析流程,基于二代测序平台,对16S/18S/ITS等特定区段PCR产物进行高通量.....

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微生物多样性云分析

描述说明:微生物多样性分析流程,基于二代测序平台,对16S rDNA/18S rDNA/ITS/功能基因等特定区段PCR产物进行高通量测序,探究环境样本中的微生物群落结构、进化关系以及微生物与环境相关性等信息。

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宏基因组云分析

描述说明:宏基因组分析流程,基于二代测序平台,以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象,解读微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络,探索微生物相互协作及与环境和宿主之间的关系等信息。

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环境生物多样性

描述说明:环境微生物多样性云分析流程,基于二代测序平台,对16S/18S/ITS/功能基因等特定区段PCR产物进行高通量测序,探索环境样本中微生物群落结构、进化关系以及微生物与理化指标相互作用等信息。

微生物多样性一站式解决方案

以环境中的微生物群落作为研究对象,扩增16s rDNA,18s rDNA,ITS,功能基因等目标区域,采用高通量测序平台和前沿的生物信息分析研究微生物群落多样性及群落结构差异,充分挖掘物种丰度、分类学及进化关系等信息。探究人类疾病、环境治理、农业耕作、畜牧养殖、地球科学等研究领域微生物多样性问题,全面、精准地为您的科研助力。

业立生物云引领微生物多样性进入交互式时代

基因测序和云计算技术的蓬勃发展引发业立生物的研发人员对生物信息大数据处理的重新思考,业立生物迎合并满足了高等院校、科研院所、医疗单位的科研工作者的科研需求,推出了业立生物信息云,推动生物学大数据信息挖掘进入以业立生物云呈递的交互时代

业立生物更懂得用户日益增长的生信分析需求,为客户源源不断的提供更丰富、更全面的微生物多样性分析服务。微生物多样性流程中的每项生信分析,涵盖了不同的分类水平、统计算法、多种参数设置,客户根据项目实际情况灵活选择,数据挖掘更全面更深入。

多样性分析流程集成业内普遍认可的QIIME、mothur等软件对测序数据进行分析,生成的图表符合专业期刊的要求。微生物多样性V4.0版的交互分析主要包括九个分析模块:数据质控,物种注释与评估,物种组成分析,样本比较分析,物种差异分析,关联与模型预测分析,进化分析等。上述分析全面的覆盖微生物多样性生信分析内容,美吉生物云会依据用户的诉求对分析内容持续更新和扩展。

医学微生物多样性

描述说明:医学微生物多样性云分析流程,基于二代测序平台,对16S/18S/ITS等特定区段PCR产物进行高通量测序,探索医学样本中微生物群落结构、进化关系以及微生物与临床指标相互作用等信息。

医学微生物多样性一站式解决方案

以临床环境中的微生物群落作为研究对象,扩增16s rDNA,18s rDNA,ITS,功能基因等目标区域,采用高通量测序平台和前沿的生物信息分析研究微生物群落多样性及群落结构差异,充分挖掘物种丰度、分类学及进化关系等信息。探究人类疾病、环境治理、农业耕作、畜牧养殖、地球科学等研究领域微生物多样性问题,全面、精准地为您的科研助力。

业立生物云引领微生物多样性进入交互式时代

基因测序和云计算技术的蓬勃发展引发业立生物的研发人员对生物信息大数据处理的重新思考,业立生物迎合并满足了高等院校、科研院所、医疗单位的科研工作者的科研需求,推出了业立生物信息云,推动生物学大数据信息挖掘进入以业立生物云呈递的交互时代

业立生物更懂得用户日益增长的生信分析需求,为客户源源不断的提供更丰富、更全面的微生物多样性分析服务。微生物多样性流程中的每项生信分析,涵盖了不同的分类水平、统计算法、多种参数设置,客户根据项目实际情况灵活选择,数据挖掘更全面更深入。

多样性分析流程集成业内普遍认可的QIIME、mothur等软件对测序数据进行分析,生成的图表符合专业期刊的要求。微生物多样性V4.0版的交互分析主要包括九个分析模块:数据质控,物种注释与评估,物种组成分析,样本比较分析,物种差异分析,关联与模型预测分析,进化分析等。上述分析全面的覆盖微生物多样性生信分析内容,美吉生物云会依据用户的诉求对分析内容持续更新和扩展。

微生物多样性云分析

描述说明:微生物多样性分析流程,基于二代测序平台,对16S rDNA/18S rDNA/ITS/功能基因等特定区段PCR产物进行高通量测序,探究环境样本中的微生物群落结构、进化关系以及微生物与环境相关性等信息。

微生物多样性云分析一站式解决方案

以环境中的微生物群落作为研究对象,扩增16s rDNA,18s rDNA,ITS,功能基因等目标区域,采用高通量测序平台和前沿的生物信息分析研究微生物群落多样性及群落结构差异,充分挖掘物种丰度、分类学及进化关系等信息。探究人类疾病、环境治理、农业耕作、畜牧养殖、地球科学等研究领域微生物多样性问题,全面、精准地为您的科研助力

业立生物云引领微生物多样性进入交互式时代

基因测序和云计算技术的蓬勃发展引发业立生物的研发人员对生物信息大数据处理的重新思考,业立生物迎合并满足了高等院校、科研院所、医疗单位的科研工作者的科研需求,推出了业立生物信息云,推动生物学大数据信息挖掘进入以业立生物云呈递的交互时代

业立生物更懂得用户日益增长的生信分析需求,为客户源源不断的提供更丰富、更全面的微生物多样性分析服务。微生物多样性流程中的每项生信分析,涵盖了不同的分类水平、统计算法、多种参数设置,客户根据项目实际情况灵活选择,数据挖掘更全面更深入。

多样性分析流程集成业内普遍认可的QIIME、mothur等软件对测序数据进行分析,生成的图表符合专业期刊的要求。微生物多样性V4.0版的交互分析主要包括九个分析模块:数据质控,物种注释与评估,物种组成分析,样本比较分析,物种差异分析,关联与模型预测分析,进化分析等。上述分析全面的覆盖微生物多样性生信分析内容,美吉生物云会依据用户的诉求对分析内容持续更新和扩展。

宏基因组云分析

描述说明:宏基因组分析流程,基于二代测序平台,以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象,解读微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络,探索微生物相互协作及与环境和宿主之间的关系等信息。

宏基因组一站式解决方案

以特定生境中的整个微生物群落为研究对象,采用高通量测序平台和前沿的生物信息分析,研究微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络、微生物相互协作关系及与环境和宿主之间的关系,探究人类疾病、环境治理、农业耕作、畜牧养殖、地球科学等研究领域微生物的功能多样性问题,全面、精准地为您的科研助力。

业立生物云引领微生物多样性进入交互式时代

美吉生物云宏基因组流程带您进入科研服务2.0时代,为客户提供一站式生物学数据可视化展示和生物学意义挖掘服务。用户无需配置Linux系统,无需安装复杂的分析软件,无需下载大量的数据库,只需在平台中选择相应的分析流程,设置参数,即可在线进行生信分析,生成准确、详细、专业的交互分析报告。大数据时代的到来促进美吉生物云平台与高通量测序的完美结合,为生物信息的发展带来无限可能。

宏基因组服务新标准,自主数据挖掘新标配

易学:零基础玩转生信,简洁的操作界面,轻松实现生信分析。
实用:自定义样本组别,支持多种算法,呈现交互报告,一键化实现项目共享。
专业:主流权威的数据库,标准化的分析流程,资深的研发服务团队,专业期刊级的结果展示。
安全:多重防御机制,文件加密保护,云端存储安全可靠。

自主分析不求人,解析数据奥秘

开启云平台数据挖掘之旅。目前,宏基因组云平台2.0的交互分析页面包括测序序列统计与质控、序列组装与基因预测、基因集构建与丰度计算、物种与功能注释、物种与功能组成分析、物种与功能比较分析、物种与功能差异分析、环境因子关联分析等,全面涵盖了宏基因组生信分析内容,也会根据用户的需求对分析内容进行更新扩展。每个分析模块的首页对各项生信分析进行了详细的知识背景介绍,帮助用户快速了解各项分析内容的应用和生物学意义。

交互体验不断优化,带来时间和空间的自由感

在宏基因组交互分析中,大到挑选样本重新分组、筛选基因、物种和功能、重新设置参数,小到搭配图案颜色、调整大小、修改标题,只需鼠标点一点,个性化图表即刻呈现。分析结果符合高水平专业期刊的发表要求。无论在哪,只要有网络,想分析哪就点哪。数据诚可贵,分析价更高,若为自由故,三者皆可收。

技术研发团队阵容

美吉生物助力的宏基因组项目涉及医学、动物、农业、环境、特殊极端环境等研究领域,强大的技术支撑、个性化的方案设计使美吉生物在微生物宏基因组测序及分析方面处于国内领先地位。

细菌比较基因组

描述说明:比较基因组学是建立在测序获得的基因组序列和图谱的基础上,在不同层面对两个及以上的多个样本基因组进行比较分析,以寻找基因组之间共同点及差异的学科。细菌比较基因组流程通过全局或局部分析可实现寻找异同,解析进化,筛选候选功能相关基因,从而达到探究微生物群体差异及进化规律的目的。

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细菌基因组云分析

描述说明:细菌基因组denovo测序,即从头测序,指在不依赖任何参考序列的情况下,对细菌基因组进行测序,利用生物信息学手段从头组装得到基因组序列。根据最终基因组组装完整程度的不同,将细菌基因组denovo测序分为扫描图测序和完成图测序。

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真菌基因组云分析

描述说明:真菌基因组denovo测序,即从头测序,指在不依赖任何参考序列的情况下,对真菌基因组进行测序,利用生物信息学手段从头组装得到基因组序列。根据最终基因组组装完整程度的不同,将真菌基因组denovo测序分为扫描图测序和精细图测序。

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重测序变异检测云分析

描述说明:全基因组重测序(Whole Genome Sequencing,WGS)是指在已知物种基因组序列(Reference genome)信息的情况下,对物种内的不同个体进行测序,发现不同个体之间的遗传变异情况。如单核苷酸多态性、插入缺失、结构变异,拷贝数变异等。

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细菌比较基因组

描述说明:比较基因组学是建立在测序获得的基因组序列和图谱的基础上,在不同层面对两个及以上的多个样本基因组进行比较分析,以寻找基因组之间共同点及差异的学科。细菌比较基因组流程通过全局或局部分析可实现寻找异同,解析进化,筛选候选功能相关基因,从而达到探究微生物群体差异及进化规律的目的。

细菌基因组云分析

描述说明:细菌基因组denovo测序,即从头测序,指在不依赖任何参考序列的情况下,对细菌基因组进行测序,利用生物信息学手段从头组装得到基因组序列。根据最终基因组组装完整程度的不同,将细菌基因组denovo测序分为扫描图测序和完成图测序。

“零”生信,照样玩转基因组

不懂Linux、perl、python语言没关系,只需选择样本、参数设置、运行即可,轻轻松松做分析达人,各类分析不再“求人”,质量周期全把控。

基因组分析可视化,分析图表DIY+各类花式下载,文章、报告统统搞定

基因组数据可视化,全局把控,全面分析,不再身陷海量数据,摆脱“只缘身在此山中”的无奈,从此你也可以“指点江山,运筹帷幄”。细菌基因组云平台支持多种格式图表下载、编辑功能;立体化数据查询,省时、省力。

真菌基因组云分析

描述说明:真菌基因组denovo测序,即从头测序,指在不依赖任何参考序列的情况下,对真菌基因组进行测序,利用生物信息学手段从头组装得到基因组序列。根据最终基因组组装完整程度的不同,将真菌基因组denovo测序分为扫描图测序和精细图测序。

1、测序数据质控

2、基因组GC-depth分布分析、K-mer频率分布分析、基因组大小评估

3、基因组组装与预测:编码基因预测、tRNA预测、rRNA预测、假基因预测、重复基因预测

4、六大功能注释:NR注释、Swiss-Prot注释、Pfam注释、COG注释、GO注释、KEGG注释

5、结构基因组查询:启动子预测、基因组图谱、基因功能查询

6、基因组圈图分析:GView基因组圈图、Circos基因组圈图

7、代谢系统分析:碳水化合物活性酶注释、细胞色素P450注释

8、致病系统分析:毒力基因预测、耐药基因预测、病原菌宿主互作分析、分泌蛋白分析、转运蛋白分析、跨膜蛋白预测

重测序变异检测云分析

描述说明:全基因组重测序(Whole Genome Sequencing,WGS)是指在已知物种基因组序列(Reference genome)信息的情况下,对物种内的不同个体进行测序,发现不同个体之间的遗传变异情况。如单核苷酸多态性、插入缺失、结构变异,拷贝数变异等。

样品基因组DNA检测合格后,利用超声波将DNA序列片段化形成随机片段,对片段化的DNA依次进行末端修复、3′端加A、连接测序接头后,再利用磁珠吸附富集基因组长度为400 bp左右的片段,经过PCR扩增形成测序文库。建好的文库先进行文库质检,质检合格的文库用Illumina HiSeqTM平台进行测序,测序策略为Illumina PE150,总测序读长为300 bp。

在Illumina HiseqTM测序数据(Raw Data)下机之后,对下机数据进行质量控制,过滤其中低质量的数据,获得高质量的数据(Clean Data)。利用BWA软件(Li et al., 2009)将Clean Data比对到参考基因组序列上,获得序列的位置归属即BAM文件。利用GATK的Best Practices流程(McKenna et al, 2010)对BAM文件进行校正,并进行SNP和Small InDel标记的检测;利用BreakDancer(Chen et al, 2009)和CNVnator(Abyzov et al, 2011)软件进行SV和CNV的结构变异检测。利用SnpEff软件(Cingolani P,2012)和参考基因组的基因预测信息进行变异功能注释,得到SNP、InDel、SV、CNV的功能注释信息,利用Circos软件(Krzywinski et al, 2009)将变异信息绘制到基因组上。

全转录组云分析

描述说明:全转录组(Whole transcriptome),是指特定组织或细胞在特定状态下转录出的所有转录本信息的总和,基于二代测序平台,采用去核糖体链特异性和小片段富集筛选的建库方法,实现编码RNA和非编码RNA(miRNA, lncRNA, circRNA)的建库、测序、生物信息学分析及联合分析、ceRNA调控网络等,研究基因表达变化的同时分析非编码RNA对其调控作用,深入挖掘解读生命现象背后的转录与调控问题。

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真核有参转录组云分析

描述说明:真核有参转录组流程,根据真核生物参考基因组,针对高通量测序数据进行表达量计算,获得基因表达差异及差异基因功能富集等信息,定量描述RNA世界,探索基因表达奥秘。

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原核转录组云分析

描述说明:原核转录组是从RNA水平研究基因表达的情况,通过细菌转录组比较分析,研究细菌在不同环境、宿主等情况下的基因表达变化,从而阐述宿主、环境对细菌的影响、细菌致病机制等。还可以深入挖掘sRNA和基因结构的信息,进一步为基因网络调控的研究提供有力支持。

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真核无参转录组云分析

描述说明:真核无参转录组流程,无需物种基因组信息,以新一代高通量转录组测序数据作为输入,通过从头(de novo)组装构建转录组,然后对获得的转录组序列,进行功能注释、表达定量、表达差异以及结构分析等,借助转录组测序之力探秘无参物种。

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全转录组云分析

描述说明:全转录组(Whole transcriptome),是指特定组织或细胞在特定状态下转录出的所有转录本信息的总和,基于二代测序平台,采用去核糖体链特异性和小片段富集筛选的建库方法,实现编码RNA和非编码RNA(miRNA, lncRNA, circRNA)的建库、测序、生物信息学分析及联合分析、ceRNA调控网络等,研究基因表达变化的同时分析非编码RNA对其调控作用,深入挖掘解读生命现象背后的转录与调控问题。

全转录组云分析一站式解决方案

全转录组(Whole transcriptome),是指特定组织或细胞在特定状态下转录出的所有转录本信息的总和。美吉生物全转录组云分析采用最优的样品处理和建库方案,能够同时检测样品中的mRNA,miRNA,lncRNA和circRNA,获取最全面的转录组信息,进而系统地研究各种RNA分子的互作关系以及ceRNA调控网络等,从而快速准确地获得与特定生物学过程(例如生长发育、疾病发生等)的数据信息,深入解读生物学现象,全面、精准地为您的科研助力。

交互体验不断优化,带来时间和空间的自由感

在全转录组交互分析中,大到挑选样本重新分组、筛选基因、重新设置参数,小到搭配图案颜色、调整大小、修改标题,只需鼠标点一点,个性化图表即刻呈现。分析结果符合高水平专业期刊的发表要求。无论在哪,只要有网络,想分析哪就点哪。数据诚可贵,分析价更高,若为自由故,三者皆可收。

真核有参转录组云分析

描述说明:真核有参转录组流程,根据真核生物参考基因组,针对高通量测序数据进行表达量计算,获得基因表达差异及差异基因功能富集等信息,定量描述RNA世界,探索基因表达奥秘。

真核有参转录组一站式解决方案

真核有参转录组采用高通量测序技术,全面快速获取真核生物特定组织或细胞在某个特定状态下转录的所有mRNA序列和丰度信息,并利用生物信息学分析基因功能、表达差异、基因结构变异、筛选分子标记(SNP/InDel)等,为生命科学研究提供精确的数据信息。

交互体验不断优化,带来时间和空间的自由感

在真核有参转录组交互分析中,大到挑选部分样本重新分组、筛选基因,重设参数,小到搭配图案颜色、调整大小、修改图题,只需鼠标点一点,个性化图表即刻呈现。分析结果符合高水平专业期刊的发表要求。无论在哪,只要有网络,想分析哪就点哪。数据诚可贵,分析价更高,若为自由故,三者皆可收。

原核转录组云分析

描述说明:原核转录组是从RNA水平研究基因表达的情况,通过细菌转录组比较分析,研究细菌在不同环境、宿主等情况下的基因表达变化,从而阐述宿主、环境对细菌的影响、细菌致病机制等。还可以深入挖掘sRNA和基因结构的信息,进一步为基因网络调控的研究提供有力支持。

生信分析全面覆盖,自主分析不求人

包含9个分析模块:项目概述、测序数据质控、序列比对分析、参考基因组注释、表达量分析、表达量差异分析、基因集分析、sRNA分析、转录本结构分析,全面覆盖原核转录组的生信分析内容。

样本自由分组,随意组合,展现多样化结果

不同样本可以自由分组,比较不同分组的基因差异表达情况,满足老师所有的分组需求,只有您不想,没有您不能。

分析软件和参数自由选,一键完成分析

生信分析软件和参数百花争艳,总有一款适合您。我们默认使用了经典的分析软件和参数进行分析,更多选择只为满足您更多的需求。

自由创建基因集,实现交互式高级分析

通过基因集创建及分析的功能,可以助您从众多基因中挖掘与研究目的或表型相关的一些基因,获得更个性化的分析结果。

SCI级高质量图片展示,自定义修改

柱形图,折线图,密度图,盒形图,小提琴图,火山图,散点图,气泡图,veen图等,各种图片可自定义修改,满足您发高分文章的需求。

项目管理安全省心

项目支持共享功能,导师、学生轻松管理项目,项目交接不再愁,数据安全永不丢失。

真核无参转录组云分析

描述说明:真核无参转录组流程,无需物种基因组信息,以新一代高通量转录组测序数据作为输入,通过从头(de novo)组装构建转录组,然后对获得的转录组序列,进行功能注释、表达定量、表达差异以及结构分析等,借助转录组测序之力探秘无参物种。

真核无参转录组一站式解决方案

真核无参转录组采用高通量测序技术,全面快速获取真核生物特定组织或细胞在某个特定状态下转录的所有mRNA序列和丰度信息,并利用生物信息学分析基因功能、表达差异、基因结构变异、筛选分子标记(SNP/InDel)等,为生命科学研究提供精确的数据信息。

交互体验不断优化,带来时间和空间的自由感

在真核无参转录组交互分析中,大到挑选部分样本重新分组、筛选基因,重设参数,小到搭配图案颜色、调整大小、修改图题,只需鼠标点一点,个性化图表即刻呈现。分析结果符合高水平专业期刊的发表要求。无论在哪,只要有网络,想分析哪就点哪。数据诚可贵,分析价更高,若为自由故,三者皆可收。

DIA蛋白组云分析

描述说明:DIA是一种是基于静电场轨道阱Orbitrap的一项全新的、全息式数据非依赖性采集定量技术。DIA利用二级碎片离子进行蛋白相对/绝对定量,一次性获得整个质量范围内所有多肽分子的图谱,结合生物信息学软件的后期分析,能够获得全面的定性定量数据结果。

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iTRAQ/TMT蛋白组云分析

描述说明:TMT iTRAQ相对定量蛋白质组学云分析流程,根据高精质谱仪数据分析结果对蛋白质进行表达量计算,获得蛋白表达差异及差异蛋白功能富集等信息,定量描述蛋白世界,探索蛋白世界的多彩奥秘。

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DIA蛋白组云分析

描述说明:DIA是一种是基于静电场轨道阱Orbitrap的一项全新的、全息式数据非依赖性采集定量技术。DIA利用二级碎片离子进行蛋白相对/绝对定量,一次性获得整个质量范围内所有多肽分子的图谱,结合生物信息学软件的后期分析,能够获得全面的定性定量数据结果。

国内领先的交互式DIA蛋白组学云分析平台

完美兼容DIA数据格式,全面快速获取特定生物在某个特定状态下蛋白表达信息,并利用生物信息学分析蛋白质功能、表达差异等内容,为生命科学研究提供精确的数据信息

不用写代码,不用配资源,轻松搞定蛋白质组学生信分析

无需Linux、perl、python、R语言基础,使用云平台各类分析自主搞定。

iTRAQ/TMT蛋白组云分析

描述说明:TMT iTRAQ相对定量蛋白质组学云分析流程,根据高精质谱仪数据分析结果对蛋白质进行表达量计算,获得蛋白表达差异及差异蛋白功能富集等信息,定量描述蛋白世界,探索蛋白世界的多彩奥秘。

国内领先的交互式TMT/iTRAQ蛋白组学云分析平台

TMT/iTRAQ相对定量蛋白组学采用同位素标记技术结合高精度、高分辨质谱仪,全面快速获取特定生物在某个特定状态下蛋白表达信息,并利用生物信息学分析蛋白质功能、表达差异等内容,为生命科学研究提供精确的数据信息。

无生信基础也能轻松搞定蛋白质组学生信分析

无需Linux、perl、python、R语言基础,使用云平台各类分析自主搞定。

代谢组云分析

描述说明:通过液质联用(LC–MS)或气质联用(GC-MS)方法检测生物体受扰动或刺激前后大量代谢产物的动态变化,通过统计学和生物信息学分析,挖掘差异表达的代谢物,进而阐明生物体代谢相关过程的非靶向代谢组学技术。

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代谢组云分析

描述说明:通过液质联用(LC–MS)或气质联用(GC-MS)方法检测生物体受扰动或刺激前后大量代谢产物的动态变化,通过统计学和生物信息学分析,挖掘差异表达的代谢物,进而阐明生物体代谢相关过程的非靶向代谢组学技术。

国内领先的代谢组分析交互式云平台

业立生物云独立自主生信云系统,项目经验丰富,分析专业,操作便捷和数据安全等优势,让您轻松玩转代谢组研究,随时随地进行数据挖掘。

代谢组学云平台内置6大分析模块,满足常规代谢组研究的所有分析需求

涵盖样本背景详情、原始数据预处理、样本比较分析、代谢物注释信息、差异代谢物分析、代谢集分析等全面系统的分析流程。

代谢组分析可视化,图表DIY,满足SCI文章发表需求

对每一项分析都有反馈,并可实时监控;所有分析图表都可下载,编辑;海量的数据都可以图片形式呈现。

个性化管理代谢集,高效筛选目标代谢物

用户可以自主选择某一类代谢物,进行所有分析,利于缩小筛选范围,准确挖掘生物学相关的代谢物